La flora eoliana è caratterizzata in gran parte dalla macchia mediterranea, in particolare dalla ginestra e fico d’india, che, con le loro maestose forme e colori, rendono l’Eolie un paesaggio mistico e unico. Gli alberi da frutta più diffusi sono il mandorlo, Il susino, il carrubbo e il fico. Il paesaggio vegetale è ricco da colture di oliveti e vigneti. Ci sono anche molti prodotti che vengono esportati in tutto il mondo, grazie alle abbondanti e uniche coltivazioni eoliane, soprattutto quella del cappero e della malsavia. Le piante diffuse sono prevalentemente erbacee,

circa 80 %, e le restanti legnose. Infine, il patrimonio floristico è stato caratterizzato dalla colonizzazione umana, composto in gran parte dal timo, rosmarino il lentisco e l'elitropia. La flora non è omogenea in tutte l’Eolie, molte delle quali si caratterizzano per determinate specie che sono approfondite nelle varie sezioni delle isole.